西暦3000年、闇の海底人が地上侵略行動を開始していた。これと闘っていた北野博士は、海底人壊滅のため、超電波の力で合体する「コンバイラーX」なる巨大ロボットを建造後、行方を眩ませてしまう。博士を探し、海底人のアジトに単身乗り込む孫娘の北野しずか。そこで目にしたのは、怪人ルイーダに捕らわれた北野博士だった。博士を助けるべくコンバイラーXの秘密を手に入れ再びアジトに乗り込むしずかだったが、海底怪人たちの罠にかかり、助けの来ない海底で卑劣な陥落地獄が始まる…。BAD END